Člověk Projekt Proteome (HPP) byl zahájen v roce 2010 po úspěšném dokončení Člověk Genome Project (HGP) k identifikaci, charakterizaci a mapování člověk proteom (celá sada proteinů exprimovaných člověk genom). Ke svému desátému výročí vydala společnost HPP první vysoce přísný plán, který pokrývá 90.4 % člověk proteom. Jako kód života má tento milník velmi významné důsledky člověk zdraví a terapie.
Dokončeno v 2003, Člověk Genome Project (HGP) byla mezinárodní spolupráce založená v roce 1990 s cílem identifikovat kompletní sadu člověk genů a určit úplnou sekvenci bází DNA v člověk genom. 15. ledna 2001 vydala společnost HGP počáteční sekvenci a analýzu člověk genom. Identifikace, charakterizace a mapování člověk proteom (celý komplement proteinů kódovaných genomem) byl dalším logickým krokem. Proto, Člověk Organizace Proteome (HUPO) byla založena 9. února 2001 s cílem podporovat výzkum proteomiky. 23. září 2010 HUPO oficiálně spuštěno Člověk Proteome Project (HPP) s cílem připravit plán projektu člověk proteom (1).
Analýza člověk genom předpovídá kolem 20,300 XNUMX genů kódujících proteiny. Celá sada proteinů kódovaných těmito geny tvoří tzv.člověk proteom“. Člověk proteom je mnohem větší než „lidský genom“, protože jeden gen může být exprimován v řadě forem (proteoforem) v důsledku chemických modifikací během a po translaci. Odhaduje se, že u jednoho jedince může koexistovat milion proteoforem. V roce 2010, na začátku HPP, bylo identifikováno sotva 70 % proteinů předpokládaných analýzou genomu. Agendou projektu proteom bylo zaplnit tuto znalostní mezeru. S pokrokem v technologii je možné detekovat a kvantifikovat proteiny a jejich formy s vyšší přesností. Přesto existuje značný počet chybějících bílkovin (Proteinů předpovězeno analýzou genomu, ale stále nedetekováno) (2,3). Projekt stále probíhá; byl však dosažen milník.
Dne 16. října 2020 na své desáté výročí vydala společnost HPP první vysoce přísný plán, který pokrývá 90.4 % lidského proteomu. (1). To výrazně zlepšuje naše znalosti biologie člověka a porozumění molekulárním mechanismům na buněčné a molekulární úrovni, zejména roli, kterou hraje lidský proteom, což přímo vede k provádění výzkumu a vývoje diagnostiky a terapeutik pro rakovinu, kardiovaskulární a infekční onemocnění, zejména pro personalizované a precizní medicína (4).
Vývoj člověka Protein Atlas představuje velmi významný pokrok pro další výzkum v oblasti humánní diagnostiky a terapie (5,6).
***
Reference:
- HUPO 2021. Časová osa proteomiky. K dispozici na https://hupo.org/Proteomics-Timeline.
- neXtProt 2021. Lidský proteom. Dostupné online na https://www.nextprot.org/about/human-proteome Zpřístupněno 30. prosince 2020.
- Inserm, 2020. Proteomika: kód života přeložen z více než 90 %. Publikováno 07. prosince 2020. Dostupné online na https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Zpřístupněno 30. prosince 2020.
- Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW a kol. 2020. Vysoce přísný plán lidského proteomu. Zveřejněno: 16. října 2020. Nature Communication 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9
- Digre A. a Lindskog C., 2020. The Human Protein Atlas – Prostorová lokalizace lidského proteomu ve zdraví a nemoci. Protein Science Volume 30, Issue 1. Poprvé publikováno: 04. listopadu 2020. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987
- The Human Protein Atlas 2020. Human Protein Atlas Dostupné online na https://www.proteinatlas.org/about Zpřístupněno 30. prosince 2020.
***
