Dříve byly hlášeny případy koinfekcí se dvěma variantami. O virové rekombinaci poskytující viry s hybridními genomy nebylo mnoho známo. Dvě nedávné studie uvádějí případy genetické rekombinace mezi variantami SARS-CoV-2 Denta & Omicron. Rekombinant zvaný Deltamicron měl rysy obou variant.
Termín 'Deltakron' se objevil na začátku tohoto roku1 k označení případů koinfekce lidí COVID-19 různými variantami variant SARS-Cov-2, např. delta a omikron. Delmicron nebo Deltacron odkazovaly na infekci způsobenou kombinací „dvou variant stejného kmene viru SARS CoV-2“ a nebyly prý odlišné“kmeny".
Nicméně případy genetické rekombinace mezi dvěma různými kmeny SARS-CoV-2 byly hlášeny nedávno. Dne 08. března 2022 výzkumníci2 ohlásili tři infekce v jižní Francii „Deltamicron“ rekombinantním s hybridem genom který měl spike protein z varianty Omicron a „tělo“ varianty Delta. Hybrid genom měl signaturní mutace dvou linií. Rekombinantní hrot by mohl optimalizovat vazbu viru na membránu hostitelské buňky.
Důkazy pro Delta a Omicron z USA se objevila rekombinace3 také. Tento tým mohl identifikovat dva nezávislé případy rekombinantní Delta-Omicron. V obou případech jde o 5′-konec viru genom byl z delty genoma 3′-end od Omicron.
Předpokládá se, že rekombinantní viry nejsou běžné a neexistuje žádný důkaz, který by naznačoval, že rekombinantní viry s hybridním genomy jsou přenosnější nebo virulentnější než dominantní cirkulující varianty.
***
Reference:
- Deltacron není nový kmen nebo varianta. Vědecký Evropan. Publikováno 9. ledna 2022. Dostupné na http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/deltacron-is-not-a-new-strain-or-variant/
- Colson, P., et al 2022. Kultura a identifikace „Deltamicron“ SARS-CoV-2 ve shluku tří případů v jižní Francii. Předtisk medRxiv. Zveřejněno 08. března 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.03.22271812
- Bolze A., et al 2022. Důkazy pro SARS-CoV-2 Delta a Omicron koinfekce a rekombinace. Předtisk medRxiv. Zveřejněno 12. března 2022. DOI: https://doi.org/10.1101/2022.03.09.22272113
***
