Varianty koronaviru: Co zatím víme

Koronaviry jsou RNA viry patřící do čeledi coronaviridae. Tyto viry vykazují pozoruhodně vysokou míru chyb během replikace kvůli nedostatku korekturní nukleázové aktivity jejich polymeráz. U jiných organismů jsou chyby replikace opraveny, ale koronaviry tuto schopnost postrádají. V důsledku toho zůstávají chyby replikace v koronavirech neopravené a hromadí se, což zase působí jako zdroj variací a adaptace v těchto koronavirech. viry. Proto bylo vždy přirozené, že koronaviry podléhají mutaci v jejich genomech extrémně vysokou rychlostí; čím více přenosu, tím více chyb replikace se stane, a tudíž více mutací v genomu, což vede k dalšímu varianty tudíž. 

Pochopitelně se mění na nové varianty není nová koronaviry. Člověk koronaviry v nedávné historii vytvářejí mutace do nových forem. Bylo jich několik varianty zodpovědný za různé epidemie od roku 1966, kdy byla zaznamenána první epizoda.  

SARS-CoV byl první smrtelnou variantou, která způsobila koronavirus epidemie v provincii Guangdong v Číně v roce 2002. MERS-CoV byla další důležitá varianta, která způsobila epidemii v Saúdské Arábii v roce 2012.  

Román koronavirus SARS-CoV-2, varianta zodpovědná za současnou pandemii COVID-19, která začala v prosinci 2019 v čínském Wu-chanu a následně se rozšířila po celém světě, aby se stala první koronavirus pandemie v lidské historii neustále procházela dalšími adaptacemi a hromadila mutace v různých geografických oblastech, které vedly k několika dílčímvarianty. Tyto dílčívarianty mají menší rozdíly ve svém genomu a spike proteinech a vykazují rozdíly v rychlosti přenosu, virulenci a imunitní únikové infekčnosti.  

Na základě hrozby, kterou tyto podvarianty představují, jsou seskupeny do tří kategorií – Varianty zájmu (VOC), zájmové varianty nebo zkoumané varianty (VOI) a sledované varianty. Toto seskupení subvariant je založeno na důkazech týkajících se přenosnosti, imunity a závažnosti infekce.    

1. Varianty zájmu (VOC) 

Varianty vzbuzující obavy (VOC) mají jasnou souvislost se zvýšením přenositelnosti nebo virulence nebo snížením účinnosti jakýchkoli opatření v oblasti veřejného zdraví, jako je účinnost vakcín, které se v současnosti používají. 

2. Zájmové varianty nebo varianty v šetření (VOI) 

Je známo, že sledované varianty nebo varianty, které jsou předmětem zkoumání (VOI), mají genetické změny, které mohou ovlivnit jejich přenosnost, virulenci nebo účinnost opatření v oblasti veřejného zdraví, a bylo zjištěno, že způsobují významný přenos v komunitě.

3. Sledované varianty  

Monitorované varianty jsou detekovány jako signály a existuje náznak, že mohou mít vlastnosti podobné VOC, ale důkazy mohou být slabé. Tyto varianty jsou proto neustále sledovány z hlediska jakýchkoli změn.  

Toto seskupení je dynamické, což znamená, že dílčí varianty mohou být odstraněny z jedné skupiny nebo zahrnuty do jakékoli skupiny v závislosti na změně hodnocení hrozeb z hlediska přenosnosti, imunity a závažnosti infekce.  

Je ironií, že vývoj SAR-CoV-2 se v současnosti zdá být probíhajícím procesem. Jdeme podle povahy tohoto virusDokud bude přenos mezi lidmi probíhat, budou docházet k chybám replikace a mutacím. Některé mutanty nebo varianty mohou překonat selekční tlak, aby se staly infekčnějšími a virulentnějšími, nebo uniknou imunitní reakci, aby byla vakcína méně účinná. Je možné, že v oblastech vyššího přenosu bude v pravý čas detekováno mnohem více variant. Minimalizace přenosu a neustálé monitorování jsou klíčem ke strategiím omezování.  

***

Zdroje:  

1. Prasad U., 2021. Nové kmeny SARS-CoV-2 ( virus zodpovědný za COVID-19): Mohl by být přístup „neutralizace protilátek“ odpovědí na rychlou mutaci? Vědecký Evropan. Publikováno 23. prosince 2020. Dostupné online na http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/  

2. WHO, 2021. Sledování variant SARS-CoV-2. Dostupné online na https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

3. ECDPC 2021. Varianty SARS-CoV-2 vzbuzující obavy od 8. července 2021. Dostupné online na https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern 

***